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基因组DNA去污剂实验步骤

发布时间:2024-04-10      点击次数:68

基因组DNA去污剂实验步骤:

(1)实验开始前将RNA提取液于65℃水浴锅中预热,离心管中加入ME(巯基乙醇),(10mL加80ul,50mL中加入300ul)

(2)取约0.8g菌丝体(液体培养获得的菌丝用真空抽滤即可!固体培养就更好说了),在液氮中迅速磨成精细粉末,装入50mL离心管,按1g材料8mL的量加入预热的RNA提取液,颠倒混匀  

(3)65℃水浴3-10 min,期间混匀2-3次

(4)加入等体积的酚(注意是酸酚pH4.5)::异戊醇(25:24:1)抽提(10,000rpm,4℃,5 min)

(5)取上清,等体积的:异戊醇(24:1)抽提(10,000rpm,4℃,5 min)

(6)加入1/4V体积10M LiCl溶液,4℃放置6h以上(或过夜)

(7)10,000rpm,4℃离心20min

(8)弃上清,用500ul SSTE溶解沉淀

(9)酚::异戊醇(25:24:1)抽提两次,:异戊醇(24:1)抽提1次(10,000rpm,4℃,5min)

(10)加2V体积的无水乙醇,在-70℃冰箱沉淀30min以上

(11)12,000rpm,4℃离心20 min

(12)弃上清.沉淀用70%酒精漂洗一次,干燥

(13)加200ul的DEPC处理水溶解

(14)用非变性琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计扫描检测RNA的质量

(在抽提过程中,若蛋白质含量或其它的杂质还较多,可以增加抽提次数)

本品采用非酶法清除RNA样品中的基因组DNA污染。每ml试剂处理~100μg RNA样品。很多用户在提取RNA的时候由于操作因素或者RNA抽提试剂质量问题,造成所得到的RNA样品中混杂基因组污染,在普通或者变性电泳的时候直接肉眼可见程度不一的DNA污染杂带。即使用市售的RNase-free的DNase消化DNA也不容易清除完全,而且常常导致RNA降解。本品不含DNA酶,在烈抑制RNA酶的条件下彻底清除RNA样品中的污染DNA杂带和蛋白质污染,同时进一步纯化RNA。后通过异丙醇沉淀回收的RNA纯度极高,完全不影响原有RNA质量和下游应用。

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