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总RNA提取实验

发布时间:2022-11-15      点击次数:409

总RNA提取可以:()获得高纯度、高质量的总RNA;(2)可以满足生物学下游实验NorthernBlot、核酸酶保护实验、RT-PCR、qRT-PCR 和阵列分析所需。
实验方法原理 总RNA 提取试剂盒,可以用来制备高质量的可用于建库的RNA 。该总RNA 纯化系统采用两种的RNA酶抑制剂,异硫氰酸弧(GTC)和β-巯基乙醇,加上整个操作都在冰浴下进行,这样就能显著降低RNA 的降解速率。

GTC和N-十二烷基肌氨酸钠的联合使用,将促使核蛋白复合体的解离,使RNA 与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。而进一步从复合体中纯化RNA ,则根据Chomczynski和Sacchi的一步快速抽提法进行,采用酸性酚-氯仿混合液抽提。低pH值的酚将使RNA进入水相,这样使其与仍留在有机相中的蛋白质和DNA分离。水相中的RNA 可用异丙醇沉淀浓缩。进一步将上述RNA沉淀复溶于GTC溶液中,接着用异丙醇进行二次沉淀,随后用乙醇洗涤沉淀,即可去除所有残留的蛋白质和无机盐,而RNA 中如含无机盐,则有可能对以后操作中的一些酶促反应产生抑制。
实验材料 微生物 动物细胞 植物组织
试剂、试剂盒 RNA 提取试剂盒 焦碳酸二乙酯 乙醇
仪器、耗材 恒温水浴 冷冻高速离心机 紫外分光光度计 取液器 电泳仪 电泳槽
 

实验步骤 一、细胞或组织破碎

. 微生物材料

()发酵3-4天(或对数生)的菌体,离心收集菌丝体(动植物材料无需此步处理)。

(2)用经DEPC处理的水洗菌丝体2-3次,并尽量除去残存的水。

(3)加液氮充分研磨,使其成为粉末,以释放RNA。

(4)研磨后的样品转移至2 ml变性液的容器中匀浆。

2. 动植物细胞培养材料 (适用的样品量为细胞:08)

()细胞或组织培养:按常规方法进行。

(2)深层悬浮培养细胞的破碎。

①细胞收集:含一定浓度的细胞培养液置于无菌离心管中,4℃,3 000 g离心5分钟。

②细胞洗涤:上步沉淀用25毫升灭菌后冰冻的×PBS缓冲液洗涤,然后4℃,3 000 g离心5分钟。

③细胞破碎:在沉淀细胞中加入5 ml预冷的变性液,用无菌处理过的匀浆器匀浆。

3. 表面培养细胞的破碎

()确定培养瓶数量,使选定的各培养瓶细胞累加后总量达08。

(2)细胞收集:将培养液倒掉,用预冷的无菌PBS缓冲液洗涤一次,在培养瓶中加入8 ml预冷变性液,转动培养瓶,使细胞溶解,此时可见粘度加大。

(3)用无菌吸管将*个培养瓶中的液体吸入第二个培养瓶,旋转,溶解细胞,再吸入第三个培养瓶,以此类推,直到将所选定的培养瓶全部洗涤一次,然后从*个培养瓶开始再加入4毫升上述变性液,将所有培养瓶洗一次。

(4)将上述2 ml含细胞的变性液转移至一50毫升无菌离心管中,匀浆破碎细胞。

3. 植物组织破碎 (适用的样品量为0.05 g组织)

()将600 ul变性液置于.5 ml离心管中,将此离心管放于冰浴中5分钟。

(2)将0.05 g新鲜组织用液氮冰冻。

(3)在液氮下,研磨组织块。

(4)待液氮挥发后,将上述分散的组织转移至无菌离心管中。

4. 动物组织破碎 (适用的样品量为 g 组织)

()将2 ml变性液置于50 ml离心管中,将此离心管放于冰浴中5分钟。

(2)在上述管中加入 g新鲜或冰冻动物组织,匀浆粉碎。

二、RNA 的抽提

() 在经变性液匀浆的细胞或组织600 ul+60 ul pH4.0的2 M 乙酸钠*混匀,可用漩涡振荡器。

(2)600 ul酚\氯仿\异戊醇(25\24\),*混匀或漩涡振荡器振荡0秒。

(3)冰裕中0-5分钟,离心,4℃,0 000 g,20分钟。

(4)上层水相吸至无菌离心管中+等体积的异丙醇,-70℃,30分钟沉淀RNA。

(5)离心4℃,0 000g,20分钟。

(6)沉淀RNA ,冷冻干燥5分钟 , RNA 沉淀重新溶于300 ul变性液中,可振荡(有时为了帮助溶解,可在65℃加热,但时间应极短)。

(7) 60 ul pH4.0的2M乙酸钠*混匀,可用漩涡振荡器。

(8) 600 ul酚\氯仿\异戊醇(25\24\),*混匀或漩涡振荡器振荡0秒。

(9) 冰裕中0-5分钟,离心,4℃,0 000 g,20分钟。

(0)上层水相吸至无菌离心管中。

() 等体积异丙醇二次沉淀(-70℃,30分钟),75%乙醇洗沉淀,沉淀冷冻干燥,复溶于去RNA 酶的水中(对于准备保存的RNA 可加入pH 5.0的乙酸钠至终浓度为0.25 M,再加入2.5体积的乙醇,-70℃保存。)。

 

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